仏像
薬師如来立像（平安時代前期）
この仏像は、33年目毎に開扉される秘仏であって、現在薬師堂の厨子内の本尊の前立仏となっている薬師坐像の胎内仏であったともいわれる。
美術史の専門家西村公朝氏の言によれば、その肥満した躰躯の下半身にY字形の衣文を刻み、彫の深さ、眼光の輝き、神秘感から見て、京都高尾の神護寺の仏像に酷似した形式（弘仁様式）であり、今からおよそ1200年前に作られたものといわれている。
薬師如来坐像（平安時代後期）
現在は秘仏として厨子に納められている薬師如来立像の前立仏として安置されているが、厨子内の立像を胎内仏として納められていたと伝えられている。
像高104センチ、寄木造、彩色（現在剥落）の地方的作風の濃い檜材による像である。
像造の構造手法では、藤原中期の様式を取り入れているが、画相、体部の肉付き、及び衣文等には藤原末期の手法が多分にあり、おそらく、製作時期としては12世紀のものと思われる。
＜本尊＞釈迦如来
普賢菩薩像
文殊菩薩像
阿弥陀如来像
地蔵菩薩（室町時代）
初代福知山城主 杉原家次公秘仏
観音菩薩坐像
仏師法眼 高村晴雲昨
氏は明治26年幕末の法眼高村東雲の孫として生まれ、一生を仏像彫刻に専念、世界的に有名なる先生である。特に、「観音の晴雲」「晴雲の観音」とまでいわれた意図である。
仏涅槃図
釈迦の入滅を説話的に描いたもので、沙羅双樹の下に永遠の涅槃に排卵として宝台に横たわる釈迦を取り巻いて、菩薩、天部、仏弟子、在家の人々などが見守り慟哭している。天空の一方からは生母摩耶婦人が急を聞いて馳せ参じるという説話的な構成である。
この涅槃図には、釈迦や菩薩の衣文などに切金の手法がみられ、室町時代の優品である。
横148×縦190センチ
釈迦十六善神図
般若十六善神像ともいう。般若教とそれを誦持する人々を守る十六の夜叉神像を描いたもので、釈迦如来を中央に、左右に普賢と文殊、十六夜叉神像を分列的に両側に配置する。
横56.5×縦131センチ
阿弥陀如来来迎図
横121.5×縦79センチ
釈迦三尊
右／普賢菩薩
中／釈迦如来
左／文殊菩薩
横56×縦131センチ
十六羅漢
羅漢とはサンクリットで尊敬を受けるに値するという意味で、仏弟子である。すなわち釈迦の教えを受けて修行を経て最高の叡知に達し、仏法を護持し大衆に広める尊者である。
天眼筆 1803年（享和3年） 横52×縦122センチ
十二天
密教が説く十二の守護神である。もともと印度のバラモン教の神々で、それが仏教に入って護法神となったもので、密教修法のときに祀られる。
春耕筆 横63×縦133センチ
晋応国師（中峰明本）
天保丙申年 南禅住持大観禅師 賛
横55.5×縦130センチ
達磨図
伝 白隠禅師 筆
横49.5×縦103センチ
虎図
朽木家第15代城主 朽木綱方公 筆 「号和龍」 天保3年
横86×縦165センチ
晋応国師（中峰明本）
朽木綱貞公 筆
横133×縦63センチ
